Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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