Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL9A3Q14050 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL9A3Q14050 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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