Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms