Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms