Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSAMPQ13449 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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