Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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