Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLFN5Q08AF3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLFN5Q08AF3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms