Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms