Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
REG3AQ06141 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
REG3AQ06141 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
REG3AQ06141 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms