Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms