Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP1P63208 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms