Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms