Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC4P59998 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms