Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAV3P56539 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAV3P56539 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms