Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms