Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERFP50548 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERFP50548 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERFP50548 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERFP50548 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms