Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACADSBP45954 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms