Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCCP43146 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCCP43146 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCCP43146 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCCP43146 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCCP43146 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCCP43146 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.2 ms