Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC26A3P40879 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms