Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms