Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms