Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-FP30511 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms