Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPB42P16452 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPB42P16452 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms