Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms