Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBQ1P09105 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBQ1P09105 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms