Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms