Protein–RNA interactions for Protein: P04424

ASL, Argininosuccinate lyase, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASLP04424 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASLP04424 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASLP04424 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASLP04424 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASLP04424 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms