Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV3-15P01624 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms