Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GASTP01350 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GASTP01350 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GASTP01350 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GASTP01350 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GASTP01350 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GASTP01350 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms