Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms