Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEBLO76041 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEBLO76041 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEBLO76041 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEBLO76041 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms