Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms