Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP2O14595 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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