Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms