Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms