Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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