Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWA8A3KMH1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms