Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms