Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD4AQ9UPU9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms