Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms