Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VANGL2Q9ULK5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms