Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms