Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms