Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MBD5Q9P267 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MBD5Q9P267 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms