Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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