Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL28Q9NXS3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms