Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDAP2Q9NXN4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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