Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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