Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms