Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-202ENST00000376237 1538 nt24.6■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRIM14-206ENST00000478530 982 ntTSL 524.32■■□□□ 1.489e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 224.3■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 524.29■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TENM4-206ENST00000531583 748 ntTSL 524.23■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 224.18■■□□□ 1.467e-10■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC016065.1-202ENST00000606853 1137 nt24.17■■□□□ 1.469e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-202ENST00000507118 669 ntTSL 1 (best)24.08■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-207ENST00000511116 847 ntTSL 1 (best)24.08■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJA3-210ENST00000574895 558 ntTSL 424.02■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OTOP2-203ENST00000584711 1365 ntTSL 524.01■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.439e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-212ENST00000597467 821 ntTSL 323.97■■□□□ 1.434e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TPD52-217ENST00000521241 723 ntTSL 523.95■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 B3GAT3-206ENST00000534715 868 ntTSL 523.95■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRELID1-208ENST00000511309 778 ntTSL 223.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VLDLR-201ENST00000382096 736 ntTSL 523.85■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TAB3-201ENST00000288422 805 ntTSL 523.79■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GFPT2-202ENST00000503228 557 ntTSL 423.78■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 323.74■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MTMR7-207ENST00000521177 506 ntTSL 323.73■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYTH2-202ENST00000391881 1546 ntTSL 523.62■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 USP13-202ENST00000482333 1966 ntTSL 523.58■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FPGS-215ENST00000481552 504 ntTSL 523.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CROCCP3-206ENST00000591348 1695 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COCH-208ENST00000555117 619 ntTSL 223.48■■□□□ 1.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 523.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TEX261-204ENST00000473055 461 ntTSL 323.35■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJA3-204ENST00000570857 554 ntTSL 323.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJA3-211ENST00000575106 837 ntTSL 423.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-213ENST00000456222 558 ntTSL 423.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 223.01■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SELENOS-202ENST00000526043 2444 ntTSL 222.87■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DGKH-207ENST00000611224 777 ntTSL 222.85■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-202ENST00000395656 1540 ntTSL 222.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WSCD2-211ENST00000551638 569 ntTSL 422.83■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX5-207ENST00000491231 1719 ntTSL 522.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.249e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FPGS-212ENST00000475765 898 ntTSL 222.78■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLC36A4-202ENST00000524875 711 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRAT-203ENST00000500890 1776 ntTSL 222.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 522.72■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EVC-205ENST00000515113 586 ntTSL 522.7■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SUGCT-204ENST00000416370 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADPGK-205ENST00000562823 514 ntTSL 422.66■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADGRB2-214ENST00000530999 1718 ntTSL 522.57■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 322.56■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJB12-205ENST00000463786 2116 ntTSL 222.52■■□□□ 1.29e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF212-204ENST00000486371 637 ntTSL 322.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRAT-205ENST00000502525 546 ntTSL 422.47■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.186e-13■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLIS3-212ENST00000477901 1327 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-204ENST00000548091 744 ntTSL 322.43■■□□□ 1.184e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-212ENST00000455608 648 ntTSL 322.4■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.186e-13■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC007388.1-202ENST00000443038 522 ntTSL 422.26■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADD2-207ENST00000425976 721 ntTSL 422.26■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC24-207ENST00000485811 982 ntTSL 522.25■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMC8-207ENST00000591144 772 ntTSL 322.23■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1655.9 ms